多年来，拉曼光谱因其便携性和取样灵活性，越来越多地用于样品分析，包括材料鉴定、生物医学研究以及艺术和考古学。在选择拉曼仪器时，首要考虑的问题就是激光波长。任何材料的拉曼特征和特定峰值位置都与材料的特别化学结构有关，与激发波长无关，因此无论波长如何，分子的指纹峰都是相同的。然而，不同的激发波长具有各自的优缺点，用户可以通过选择拉曼激光波长来优化不同样品的测量。那么，如何为特定应用选择激发波长呢？激发波长有很多种，但使用非常广泛的三种波长是 532 nm、785 nm 和 1064 nm。非常常用的是 785 nm 激发系统，因为它在信号强度、荧光灵敏度、成本和整体性能方面实现了非常合适的平衡，可用于快速采集大多数有机材料的拉曼光谱。
三种波长的一些重要性能指标如下：
非常明显的区别在于激发效率。拉曼散射效率与 λ-4 成正比，其中 λ 是激光波长。例如，532 nm 波长的拉曼散射效率是 785 nm 波长的 4.7 倍，是 1064 nm 波长的 16 倍，这实际上意味着，在所有其他条件不变的情况下，使用更长的激光波长采集光谱，需要更长的扫描时间。
检测器的灵敏度是另一个值得关注的问题。由于大多数532 nm激光激发的拉曼信号分布在可见光范围内，这对于大多数硅基 CCD 检测器来说响应非常合适。同时，785 nm 系统产生的拉曼信号属于近红外范围（750-1050 nm），其响应仍然相对较好。然而，对于 1064 nm，由于硅在 1100 nm以上没有响应，对近红外敏感的 InGaAs 阵列检测器通常被使用。此外，出于成本控制的考虑，大多数1064 nm拉曼仪器都嵌入了 512 像素传感器（而大多数其他波长仪器则为 2048 像素），这导致检测器像素分辨率相对较低，拉曼偏移覆盖范围可能较小。
荧光是另外一个重要因素。荧光的产生过程与拉曼散射非常相似，都是基于光致发光机制。拉曼峰与激发频率保持恒定的间隔，而荧光则固定在特定的频率或波长上，这意味着它不会随激发激光的变化而变化。为了尽量减少荧光对拉曼光谱的干扰，建议使用较长波长的激光。在测量深色样品、染料和天然产品时，荧光可能会更强。
另外需要考虑样品对激光能量的吸收，因为这可能会导致样品发热，从而引起样品的变化。一般来说，激发波长越长，样品对光的吸收就越多，也就越容易被加热。在极端情况下，小体积液体样品可能会沸腾，而有色、深色或黑色样品可能会损坏。通过旋转样品或降低样品的激光功率密度，可以避免或尽量减少与激光能量吸收相关的样品损坏，但这些步骤会增加复杂性和测量时间。因此，在某些不正确的测量配置下，即使拉曼是一种无损技术，也有可能因处理不当而造成样品损坏。 在选择波长时，还应考虑共振拉曼效应等其他因素。
下面，我们将展示一些光谱样本，它们显示了各种激发的不同性能。须指出的是，有许多材料可以毫无问题地使用任何波长进行扫描。示例中显示，使用所有三种标准激发激光都可以轻松测量甲苯的拉曼光谱。
785 nm 是非常常用、非常普遍的波长，因为它对 90% 以上的拉曼活性材料有效，荧光干扰有限。根据样品和相应拉曼信号强度的不同，一次扫描采集可能需要一秒到几分钟不等。在 3 个标准波长之间，785 nm 波长在减少荧光和光谱分辨率之间取得了平衡，是非常受欢迎的选择。
在左侧使用 785 nm 和 1064 nm 激发波长扫描的海洛因基底光谱中，785 nm 波长的光谱因分辨率更高而显示出更多细节，但由于荧光的影响，基线会出现倾斜。在大多数情况下，选择 1064 纳米激光激发可减少荧光。
尽管过去人们对纤维素中的荧光表示担忧，但使用 785 nm和 1064 nm可以采集到很好的光谱，使用 1064 nm采集到的本底辐射较低。只有在使用 532 nm波长时，荧光才会对纤维素拉曼光谱的测量产生不利影响。
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